粵港澳物流合作園將培育成具有創新亮點的生態低碳型的第三代物流園區、國內外有影響力的物流營商新園區。建設集港口、自貿區、綜保區、漁港等一體化的區港聯動物流發展區、成為珠港澳三地物流合作示范區、承接國家“三互”查驗機制的創新試點、進出港澳物流和國際市場的物流樞紐、大西南地區的出海平臺、川貴廣-港澳-南亞國際物流大通道的門戶和21世紀海上絲綢之路的重要節點。
粵港澳物流合作園規劃總占地面積為90萬平方米（1350畝），總體投資預算34.875億元人民幣，建設工期為3.5年時間，粵港澳物流合作園總體功能布局規劃為“一園、十區、兩平臺”。
一園：即粵港澳物流合作園。
十區：設立綜合陸路口岸聯檢區、國際甩掛服務區、跨境電商服務區、智慧農副食品加工配送區、華南物流裝備展示交易區、物聯網應用示范區、金融物流服務區、區港聯動綜合配套區、港澳物流合作區、貴物流分撥區等十個功能區。
兩平臺：海關聯檢保稅公共信息平臺、國際物流采購展示交易公共信息平臺兩個平臺。
